* 華嚴一乘法界圖一卷 7-79
* 大方廣佛華嚴經疏一卷 7-2
* 華嚴經文義要決問答四卷 6-721
* 金剛三昧經論三卷 6-794
* 梵網經菩薩戒本私記一卷 7-2
* 菩薩戒本持犯要記一卷 7-1
* 梵網經菩薩戒本述記四卷 7-38
* 梵網經菩薩戒本疏四卷 7-39
* 菩薩戒本宗要一卷 7-58
* 梵網經古迹記六卷 7-58
* 妙法蓮華經宗要一卷 6-799
* 妙華蓮華經論述記一卷 6-775
* 無量壽經宗要一卷 6-796
* 無量壽經連義述文贊三卷 6-125
* 無量壽經記一卷 6-712
* 觀彌勒菩薩上生兜率天經宗要一卷 6-797
* 觀彌勒菩薩上生兜率天經疏一卷 7-125
* 大慧度經宗要一卷 6-798
* 菩薩瓔珞本業經疏一卷 7-3
* 佛說阿彌陀經疏一卷 6-795
* 大般涅槃經宗要一卷 6-800
* 大乘起信論疏記六卷 7-78
* 大乘起信論內義略探記一卷 7-60
* 大乘起信論同異略集二卷 7-60
* 大乘六情懺悔一卷 7-1
* 中邊分別論疏一卷 7-3
* 遊心安樂道一卷 7-4
* 瑜伽師地論記一百卷 7-124
* 彌勒成佛經疏一卷 7-126
* 彌勒下生經疏一卷 7-126
* 大毘盧遮那成佛神變加持經供養次第法疏二卷 6-715
* 毗那夜迦誐那鉢底瑜伽悉地品秘要一卷 6-722
* 藥師瑠璃光如來本願功德經古迹二卷 7-57
* 成唯識論學記十二卷 7-59
* 海印三昧論 6-711
* 麗藏新雕本校記一卷 26-779
* 天台四教儀一卷 6-697
* 朝鮮禪教考一卷 26-494
* 阿育王息壞目因緣經一卷 22-62
* 無畏三藏禪要一卷 6-714
* 念誦結護法普通諸部一卷 6-713
* 答修禪院問一卷 6-753
* 答日本光定法師問一卷 6-754
* 戒律傳來記三卷 26-703
* 答日本國三十問一卷 6-751
* 答日本國三十問一卷 6-752
* 答日本德圓法師問一卷 6-754
* 三國佛法傳通緣起三卷 26-656
* 釋家官班記二卷 26-676
* 三國傳記十二卷 26-685
* 得依釋序文緣起一卷 26-435
* 金剛經靈驗傳三卷 26-503
* 御製大藏經序跋集一卷 26-733
* 釋門事物紀原初篇二卷 37-525
* 五體般若心經一卷 5-632
* 真言宗小史不分卷 26-469
* 印度佛教史略二篇 26-542
* 佛學研究 2-615