* 慎柔五書五卷 10-587
* 增訂傷暑全書三卷 10-285
* 醫效秘傳三卷附溫熱贅言一卷 10-380
* 何氏心傳一卷 10-403
* 時病論八卷 10-453
* 張氏溫暑醫旨一卷醫案二卷 10-326
* 評琴書屋醫略三卷 10-474
* 四時病機十四卷 10-427
* 疫疹一得二卷 10-673
* 廣瘟疫論四卷 10-625
* 溫熱論一卷幼科要略二卷附葉案存真二卷 10-662
* 溫證指歸四卷 10-294
* 溫病條辨六卷 10-608
* 松峰說疫六卷瘟疫論類編五卷 10-449
* 瘟疫霍亂答門一卷附霍亂審證舉要一卷 10-332
* 溫疫析疑四卷 10-381
* 溫熱逢源三卷 10-331
* 刪訂痧證全書三卷 10-410
* 痧脈玉衡四卷 10-607
* 痢疾論四卷 10-554
* 痢證匯參十卷 10-387
* 金匱瘧病篇正義一卷 10-462